Protein–RNA interactions for Protein: P15621

ZNF44, Zinc finger protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF44P15621 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF44P15621 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF44P15621 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF44P15621 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF44P15621 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF44P15621 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF44P15621 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF44P15621 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF44P15621 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF44P15621 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF44P15621 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF44P15621 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF44P15621 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF44P15621 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF44P15621 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF44P15621 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF44P15621 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF44P15621 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF44P15621 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF44P15621 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF44P15621 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF44P15621 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF44P15621 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF44P15621 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF44P15621 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF44P15621 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF44P15621 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF44P15621 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF44P15621 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF44P15621 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF44P15621 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF44P15621 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF44P15621 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF44P15621 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF44P15621 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF44P15621 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF44P15621 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF44P15621 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF44P15621 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF44P15621 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF44P15621 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF44P15621 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF44P15621 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF44P15621 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF44P15621 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF44P15621 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF44P15621 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF44P15621 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF44P15621 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF44P15621 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF44P15621 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF44P15621 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF44P15621 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF44P15621 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF44P15621 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF44P15621 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF44P15621 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF44P15621 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF44P15621 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF44P15621 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF44P15621 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF44P15621 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF44P15621 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms