Protein–RNA interactions for Protein: P08134

RHOC, Rho-related GTP-binding protein RhoC, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOCP08134 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOCP08134 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOCP08134 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOCP08134 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOCP08134 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOCP08134 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOCP08134 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOCP08134 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOCP08134 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOCP08134 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOCP08134 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOCP08134 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOCP08134 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOCP08134 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOCP08134 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOCP08134 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOCP08134 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOCP08134 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOCP08134 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOCP08134 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOCP08134 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOCP08134 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOCP08134 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOCP08134 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOCP08134 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOCP08134 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOCP08134 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOCP08134 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOCP08134 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOCP08134 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOCP08134 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOCP08134 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOCP08134 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOCP08134 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOCP08134 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOCP08134 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOCP08134 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOCP08134 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOCP08134 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOCP08134 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOCP08134 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOCP08134 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOCP08134 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOCP08134 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOCP08134 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOCP08134 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOCP08134 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOCP08134 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOCP08134 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOCP08134 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOCP08134 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOCP08134 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOCP08134 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOCP08134 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOCP08134 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOCP08134 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOCP08134 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOCP08134 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOCP08134 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOCP08134 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOCP08134 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOCP08134 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOCP08134 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RHOCP08134 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RHOCP08134 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
RHOCP08134 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RHOCP08134 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHOCP08134 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHOCP08134 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHOCP08134 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHOCP08134 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOCP08134 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOCP08134 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOCP08134 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOCP08134 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOCP08134 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOCP08134 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOCP08134 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOCP08134 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOCP08134 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOCP08134 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOCP08134 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOCP08134 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOCP08134 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOCP08134 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOCP08134 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOCP08134 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOCP08134 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOCP08134 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOCP08134 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOCP08134 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOCP08134 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOCP08134 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOCP08134 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOCP08134 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOCP08134 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOCP08134 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOCP08134 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOCP08134 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOCP08134 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms