Protein–RNA interactions for Protein: O60493

SNX3, Sorting nexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX3O60493 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX3O60493 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX3O60493 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX3O60493 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX3O60493 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX3O60493 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX3O60493 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX3O60493 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX3O60493 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX3O60493 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX3O60493 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX3O60493 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX3O60493 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX3O60493 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX3O60493 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX3O60493 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX3O60493 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX3O60493 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX3O60493 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX3O60493 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX3O60493 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX3O60493 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX3O60493 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX3O60493 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX3O60493 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX3O60493 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX3O60493 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX3O60493 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX3O60493 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX3O60493 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX3O60493 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX3O60493 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX3O60493 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX3O60493 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX3O60493 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX3O60493 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX3O60493 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX3O60493 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX3O60493 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX3O60493 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX3O60493 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX3O60493 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX3O60493 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX3O60493 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX3O60493 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX3O60493 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX3O60493 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX3O60493 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX3O60493 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX3O60493 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX3O60493 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX3O60493 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX3O60493 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX3O60493 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX3O60493 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX3O60493 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX3O60493 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX3O60493 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX3O60493 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX3O60493 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX3O60493 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX3O60493 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX3O60493 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX3O60493 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX3O60493 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX3O60493 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX3O60493 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX3O60493 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX3O60493 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX3O60493 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX3O60493 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX3O60493 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX3O60493 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX3O60493 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX3O60493 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX3O60493 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX3O60493 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX3O60493 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX3O60493 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX3O60493 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX3O60493 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX3O60493 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX3O60493 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX3O60493 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX3O60493 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX3O60493 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX3O60493 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX3O60493 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX3O60493 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX3O60493 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX3O60493 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX3O60493 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX3O60493 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX3O60493 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX3O60493 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX3O60493 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX3O60493 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX3O60493 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX3O60493 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX3O60493 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms