Protein–RNA interactions for Protein: O00409

FOXN3, Forkhead box protein N3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3O00409 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXN3O00409 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXN3O00409 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXN3O00409 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXN3O00409 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXN3O00409 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXN3O00409 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXN3O00409 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXN3O00409 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXN3O00409 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXN3O00409 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXN3O00409 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXN3O00409 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXN3O00409 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXN3O00409 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXN3O00409 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXN3O00409 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXN3O00409 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXN3O00409 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXN3O00409 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXN3O00409 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXN3O00409 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXN3O00409 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXN3O00409 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXN3O00409 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXN3O00409 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXN3O00409 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXN3O00409 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXN3O00409 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXN3O00409 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXN3O00409 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXN3O00409 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXN3O00409 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXN3O00409 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXN3O00409 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXN3O00409 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
FOXN3O00409 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXN3O00409 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXN3O00409 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXN3O00409 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXN3O00409 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXN3O00409 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FOXN3O00409 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOXN3O00409 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXN3O00409 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXN3O00409 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXN3O00409 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXN3O00409 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXN3O00409 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXN3O00409 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXN3O00409 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXN3O00409 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXN3O00409 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXN3O00409 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXN3O00409 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXN3O00409 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXN3O00409 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXN3O00409 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXN3O00409 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXN3O00409 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXN3O00409 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXN3O00409 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXN3O00409 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXN3O00409 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXN3O00409 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXN3O00409 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXN3O00409 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXN3O00409 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXN3O00409 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXN3O00409 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXN3O00409 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXN3O00409 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXN3O00409 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXN3O00409 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXN3O00409 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXN3O00409 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXN3O00409 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXN3O00409 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXN3O00409 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXN3O00409 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXN3O00409 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FOXN3O00409 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
FOXN3O00409 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
FOXN3O00409 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
FOXN3O00409 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXN3O00409 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXN3O00409 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXN3O00409 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXN3O00409 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXN3O00409 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXN3O00409 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXN3O00409 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXN3O00409 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXN3O00409 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXN3O00409 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXN3O00409 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXN3O00409 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXN3O00409 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXN3O00409 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXN3O00409 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms