Protein–RNA interactions for Protein: A6PVS8

LRRIQ3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ3A6PVS8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRIQ3A6PVS8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRIQ3A6PVS8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRIQ3A6PVS8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRIQ3A6PVS8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRIQ3A6PVS8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRIQ3A6PVS8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRIQ3A6PVS8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRIQ3A6PVS8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRIQ3A6PVS8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRIQ3A6PVS8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRIQ3A6PVS8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRIQ3A6PVS8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRIQ3A6PVS8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRIQ3A6PVS8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRIQ3A6PVS8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRIQ3A6PVS8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRIQ3A6PVS8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRIQ3A6PVS8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRIQ3A6PVS8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRIQ3A6PVS8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRIQ3A6PVS8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRIQ3A6PVS8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRIQ3A6PVS8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRIQ3A6PVS8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRIQ3A6PVS8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRIQ3A6PVS8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRIQ3A6PVS8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRIQ3A6PVS8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRIQ3A6PVS8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRIQ3A6PVS8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRIQ3A6PVS8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRIQ3A6PVS8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRIQ3A6PVS8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRIQ3A6PVS8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRIQ3A6PVS8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRIQ3A6PVS8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRIQ3A6PVS8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRIQ3A6PVS8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRIQ3A6PVS8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRIQ3A6PVS8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRIQ3A6PVS8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRIQ3A6PVS8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRIQ3A6PVS8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRIQ3A6PVS8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRIQ3A6PVS8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRIQ3A6PVS8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRIQ3A6PVS8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRRIQ3A6PVS8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRRIQ3A6PVS8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRIQ3A6PVS8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRIQ3A6PVS8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRIQ3A6PVS8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRIQ3A6PVS8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRIQ3A6PVS8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRIQ3A6PVS8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRIQ3A6PVS8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRIQ3A6PVS8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRIQ3A6PVS8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRIQ3A6PVS8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRIQ3A6PVS8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRIQ3A6PVS8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRIQ3A6PVS8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRIQ3A6PVS8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRIQ3A6PVS8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRIQ3A6PVS8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRIQ3A6PVS8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRIQ3A6PVS8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRIQ3A6PVS8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRIQ3A6PVS8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRIQ3A6PVS8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRIQ3A6PVS8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRIQ3A6PVS8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms