Protein–RNA interactions for Protein: A6NED2

RCCD1, RCC1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1A6NED2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RCCD1A6NED2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RCCD1A6NED2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RCCD1A6NED2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RCCD1A6NED2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RCCD1A6NED2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RCCD1A6NED2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RCCD1A6NED2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RCCD1A6NED2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RCCD1A6NED2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RCCD1A6NED2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RCCD1A6NED2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RCCD1A6NED2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RCCD1A6NED2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RCCD1A6NED2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RCCD1A6NED2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RCCD1A6NED2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RCCD1A6NED2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RCCD1A6NED2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RCCD1A6NED2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RCCD1A6NED2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RCCD1A6NED2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RCCD1A6NED2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RCCD1A6NED2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RCCD1A6NED2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RCCD1A6NED2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RCCD1A6NED2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RCCD1A6NED2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RCCD1A6NED2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RCCD1A6NED2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RCCD1A6NED2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RCCD1A6NED2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RCCD1A6NED2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RCCD1A6NED2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RCCD1A6NED2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RCCD1A6NED2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RCCD1A6NED2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RCCD1A6NED2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RCCD1A6NED2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RCCD1A6NED2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RCCD1A6NED2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RCCD1A6NED2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RCCD1A6NED2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RCCD1A6NED2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RCCD1A6NED2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RCCD1A6NED2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RCCD1A6NED2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RCCD1A6NED2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RCCD1A6NED2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RCCD1A6NED2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RCCD1A6NED2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RCCD1A6NED2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RCCD1A6NED2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RCCD1A6NED2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RCCD1A6NED2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RCCD1A6NED2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RCCD1A6NED2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RCCD1A6NED2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RCCD1A6NED2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RCCD1A6NED2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RCCD1A6NED2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCCD1A6NED2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCCD1A6NED2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCCD1A6NED2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCCD1A6NED2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RCCD1A6NED2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCCD1A6NED2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCCD1A6NED2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCCD1A6NED2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RCCD1A6NED2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RCCD1A6NED2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RCCD1A6NED2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RCCD1A6NED2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RCCD1A6NED2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RCCD1A6NED2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RCCD1A6NED2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RCCD1A6NED2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RCCD1A6NED2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RCCD1A6NED2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RCCD1A6NED2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RCCD1A6NED2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RCCD1A6NED2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RCCD1A6NED2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RCCD1A6NED2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RCCD1A6NED2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RCCD1A6NED2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RCCD1A6NED2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RCCD1A6NED2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RCCD1A6NED2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RCCD1A6NED2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RCCD1A6NED2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RCCD1A6NED2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RCCD1A6NED2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RCCD1A6NED2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RCCD1A6NED2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RCCD1A6NED2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RCCD1A6NED2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RCCD1A6NED2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RCCD1A6NED2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RCCD1A6NED2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms