Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X0B3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087X0B3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A087X0B3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A087X0B3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A087X0B3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A087X0B3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A087X0B3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A087X0B3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A087X0B3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A087X0B3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A087X0B3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A087X0B3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A087X0B3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A087X0B3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A087X0B3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A087X0B3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A087X0B3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
A0A087X0B3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
A0A087X0B3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
A0A087X0B3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A087X0B3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A087X0B3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A087X0B3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A087X0B3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A087X0B3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A087X0B3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A087X0B3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A087X0B3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A087X0B3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A087X0B3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A087X0B3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A087X0B3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A087X0B3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A087X0B3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A087X0B3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A087X0B3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A087X0B3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A087X0B3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A087X0B3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A087X0B3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A087X0B3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A087X0B3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A087X0B3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A087X0B3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A087X0B3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A087X0B3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A087X0B3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A087X0B3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A087X0B3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A087X0B3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A087X0B3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A087X0B3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A087X0B3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A087X0B3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A087X0B3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A087X0B3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A087X0B3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A087X0B3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A087X0B3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A087X0B3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A087X0B3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A087X0B3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A087X0B3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A087X0B3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A087X0B3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A087X0B3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A087X0B3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A087X0B3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A087X0B3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A087X0B3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A087X0B3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A087X0B3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A087X0B3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A087X0B3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A087X0B3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A087X0B3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A087X0B3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
A0A087X0B3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
A0A087X0B3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
A0A087X0B3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
A0A087X0B3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
A0A087X0B3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
A0A087X0B3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A087X0B3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A087X0B3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A087X0B3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A087X0B3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A087X0B3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A087X0B3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A087X0B3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A087X0B3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A087X0B3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A087X0B3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A087X0B3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A087X0B3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A087X0B3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A087X0B3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
A0A087X0B3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
A0A087X0B3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
A0A087X0B3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
A0A087X0B3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms