Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PAXBP1Q9Y5B6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PAXBP1Q9Y5B6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PAXBP1Q9Y5B6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PAXBP1Q9Y5B6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PAXBP1Q9Y5B6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PAXBP1Q9Y5B6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PAXBP1Q9Y5B6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PAXBP1Q9Y5B6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PAXBP1Q9Y5B6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PAXBP1Q9Y5B6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PAXBP1Q9Y5B6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PAXBP1Q9Y5B6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PAXBP1Q9Y5B6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PAXBP1Q9Y5B6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PAXBP1Q9Y5B6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PAXBP1Q9Y5B6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PAXBP1Q9Y5B6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PAXBP1Q9Y5B6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PAXBP1Q9Y5B6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PAXBP1Q9Y5B6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PAXBP1Q9Y5B6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PAXBP1Q9Y5B6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PAXBP1Q9Y5B6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PAXBP1Q9Y5B6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PAXBP1Q9Y5B6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PAXBP1Q9Y5B6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PAXBP1Q9Y5B6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PAXBP1Q9Y5B6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PAXBP1Q9Y5B6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PAXBP1Q9Y5B6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PAXBP1Q9Y5B6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PAXBP1Q9Y5B6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PAXBP1Q9Y5B6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PAXBP1Q9Y5B6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PAXBP1Q9Y5B6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PAXBP1Q9Y5B6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PAXBP1Q9Y5B6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PAXBP1Q9Y5B6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PAXBP1Q9Y5B6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PAXBP1Q9Y5B6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PAXBP1Q9Y5B6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PAXBP1Q9Y5B6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PAXBP1Q9Y5B6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PAXBP1Q9Y5B6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PAXBP1Q9Y5B6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PAXBP1Q9Y5B6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PAXBP1Q9Y5B6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PAXBP1Q9Y5B6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PAXBP1Q9Y5B6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PAXBP1Q9Y5B6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PAXBP1Q9Y5B6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PAXBP1Q9Y5B6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PAXBP1Q9Y5B6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PAXBP1Q9Y5B6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PAXBP1Q9Y5B6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PAXBP1Q9Y5B6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PAXBP1Q9Y5B6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PAXBP1Q9Y5B6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PAXBP1Q9Y5B6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PAXBP1Q9Y5B6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PAXBP1Q9Y5B6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PAXBP1Q9Y5B6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PAXBP1Q9Y5B6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PAXBP1Q9Y5B6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PAXBP1Q9Y5B6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PAXBP1Q9Y5B6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PAXBP1Q9Y5B6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PAXBP1Q9Y5B6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PAXBP1Q9Y5B6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PAXBP1Q9Y5B6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PAXBP1Q9Y5B6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PAXBP1Q9Y5B6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PAXBP1Q9Y5B6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PAXBP1Q9Y5B6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PAXBP1Q9Y5B6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PAXBP1Q9Y5B6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PAXBP1Q9Y5B6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PAXBP1Q9Y5B6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PAXBP1Q9Y5B6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PAXBP1Q9Y5B6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms