Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms