Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y324

FCF1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCF1Q9Y324 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FCF1Q9Y324 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FCF1Q9Y324 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms