Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP8A1Q9Y2Q0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP8A1Q9Y2Q0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP8A1Q9Y2Q0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP8A1Q9Y2Q0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP8A1Q9Y2Q0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP8A1Q9Y2Q0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP8A1Q9Y2Q0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP8A1Q9Y2Q0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP8A1Q9Y2Q0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP8A1Q9Y2Q0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP8A1Q9Y2Q0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP8A1Q9Y2Q0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP8A1Q9Y2Q0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP8A1Q9Y2Q0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP8A1Q9Y2Q0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP8A1Q9Y2Q0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP8A1Q9Y2Q0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP8A1Q9Y2Q0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP8A1Q9Y2Q0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP8A1Q9Y2Q0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP8A1Q9Y2Q0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP8A1Q9Y2Q0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATP8A1Q9Y2Q0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP8A1Q9Y2Q0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP8A1Q9Y2Q0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms