Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C4Q9UKN8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C4Q9UKN8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF3C4Q9UKN8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF3C4Q9UKN8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF3C4Q9UKN8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF3C4Q9UKN8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF3C4Q9UKN8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF3C4Q9UKN8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF3C4Q9UKN8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF3C4Q9UKN8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF3C4Q9UKN8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF3C4Q9UKN8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF3C4Q9UKN8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF3C4Q9UKN8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF3C4Q9UKN8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF3C4Q9UKN8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF3C4Q9UKN8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF3C4Q9UKN8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF3C4Q9UKN8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF3C4Q9UKN8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF3C4Q9UKN8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF3C4Q9UKN8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF3C4Q9UKN8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF3C4Q9UKN8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF3C4Q9UKN8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF3C4Q9UKN8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF3C4Q9UKN8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF3C4Q9UKN8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF3C4Q9UKN8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF3C4Q9UKN8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF3C4Q9UKN8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF3C4Q9UKN8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF3C4Q9UKN8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF3C4Q9UKN8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF3C4Q9UKN8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF3C4Q9UKN8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF3C4Q9UKN8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
GTF3C4Q9UKN8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF3C4Q9UKN8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF3C4Q9UKN8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF3C4Q9UKN8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF3C4Q9UKN8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF3C4Q9UKN8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF3C4Q9UKN8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF3C4Q9UKN8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF3C4Q9UKN8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF3C4Q9UKN8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF3C4Q9UKN8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF3C4Q9UKN8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF3C4Q9UKN8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF3C4Q9UKN8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF3C4Q9UKN8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF3C4Q9UKN8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF3C4Q9UKN8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF3C4Q9UKN8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF3C4Q9UKN8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF3C4Q9UKN8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF3C4Q9UKN8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF3C4Q9UKN8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF3C4Q9UKN8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF3C4Q9UKN8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF3C4Q9UKN8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF3C4Q9UKN8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF3C4Q9UKN8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF3C4Q9UKN8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF3C4Q9UKN8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF3C4Q9UKN8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF3C4Q9UKN8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF3C4Q9UKN8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF3C4Q9UKN8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF3C4Q9UKN8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF3C4Q9UKN8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF3C4Q9UKN8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF3C4Q9UKN8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF3C4Q9UKN8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF3C4Q9UKN8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF3C4Q9UKN8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF3C4Q9UKN8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF3C4Q9UKN8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF3C4Q9UKN8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF3C4Q9UKN8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF3C4Q9UKN8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF3C4Q9UKN8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF3C4Q9UKN8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF3C4Q9UKN8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF3C4Q9UKN8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF3C4Q9UKN8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF3C4Q9UKN8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF3C4Q9UKN8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF3C4Q9UKN8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF3C4Q9UKN8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF3C4Q9UKN8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
GTF3C4Q9UKN8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GTF3C4Q9UKN8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
GTF3C4Q9UKN8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF3C4Q9UKN8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF3C4Q9UKN8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF3C4Q9UKN8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF3C4Q9UKN8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms