Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI09

NDUFA12, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA12Q9UI09 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA12Q9UI09 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA12Q9UI09 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA12Q9UI09 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA12Q9UI09 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA12Q9UI09 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA12Q9UI09 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA12Q9UI09 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA12Q9UI09 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA12Q9UI09 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA12Q9UI09 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA12Q9UI09 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA12Q9UI09 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA12Q9UI09 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA12Q9UI09 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA12Q9UI09 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA12Q9UI09 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA12Q9UI09 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA12Q9UI09 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA12Q9UI09 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA12Q9UI09 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA12Q9UI09 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA12Q9UI09 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA12Q9UI09 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA12Q9UI09 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA12Q9UI09 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA12Q9UI09 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA12Q9UI09 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFA12Q9UI09 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFA12Q9UI09 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFA12Q9UI09 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFA12Q9UI09 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFA12Q9UI09 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFA12Q9UI09 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFA12Q9UI09 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFA12Q9UI09 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFA12Q9UI09 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFA12Q9UI09 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFA12Q9UI09 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFA12Q9UI09 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFA12Q9UI09 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFA12Q9UI09 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFA12Q9UI09 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NDUFA12Q9UI09 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NDUFA12Q9UI09 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFA12Q9UI09 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFA12Q9UI09 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFA12Q9UI09 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFA12Q9UI09 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFA12Q9UI09 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFA12Q9UI09 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFA12Q9UI09 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFA12Q9UI09 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFA12Q9UI09 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFA12Q9UI09 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFA12Q9UI09 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFA12Q9UI09 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFA12Q9UI09 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFA12Q9UI09 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFA12Q9UI09 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFA12Q9UI09 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFA12Q9UI09 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFA12Q9UI09 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFA12Q9UI09 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFA12Q9UI09 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFA12Q9UI09 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFA12Q9UI09 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFA12Q9UI09 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFA12Q9UI09 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFA12Q9UI09 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFA12Q9UI09 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFA12Q9UI09 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA12Q9UI09 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA12Q9UI09 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA12Q9UI09 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA12Q9UI09 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA12Q9UI09 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA12Q9UI09 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA12Q9UI09 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA12Q9UI09 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA12Q9UI09 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA12Q9UI09 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA12Q9UI09 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA12Q9UI09 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA12Q9UI09 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA12Q9UI09 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA12Q9UI09 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFA12Q9UI09 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFA12Q9UI09 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFA12Q9UI09 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFA12Q9UI09 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFA12Q9UI09 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFA12Q9UI09 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFA12Q9UI09 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFA12Q9UI09 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFA12Q9UI09 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFA12Q9UI09 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFA12Q9UI09 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFA12Q9UI09 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDUFA12Q9UI09 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms