Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI1

FANCI, Fanconi anemia group I protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCIQ9NVI1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FANCIQ9NVI1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FANCIQ9NVI1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FANCIQ9NVI1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FANCIQ9NVI1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FANCIQ9NVI1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FANCIQ9NVI1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FANCIQ9NVI1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FANCIQ9NVI1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FANCIQ9NVI1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FANCIQ9NVI1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FANCIQ9NVI1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FANCIQ9NVI1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
FANCIQ9NVI1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
FANCIQ9NVI1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FANCIQ9NVI1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
FANCIQ9NVI1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
FANCIQ9NVI1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FANCIQ9NVI1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FANCIQ9NVI1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FANCIQ9NVI1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FANCIQ9NVI1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FANCIQ9NVI1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
FANCIQ9NVI1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
FANCIQ9NVI1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FANCIQ9NVI1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FANCIQ9NVI1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FANCIQ9NVI1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FANCIQ9NVI1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FANCIQ9NVI1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FANCIQ9NVI1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FANCIQ9NVI1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FANCIQ9NVI1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FANCIQ9NVI1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FANCIQ9NVI1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FANCIQ9NVI1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
FANCIQ9NVI1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
FANCIQ9NVI1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
FANCIQ9NVI1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
FANCIQ9NVI1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
FANCIQ9NVI1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
FANCIQ9NVI1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
FANCIQ9NVI1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
FANCIQ9NVI1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
FANCIQ9NVI1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
FANCIQ9NVI1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
FANCIQ9NVI1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
FANCIQ9NVI1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
FANCIQ9NVI1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
FANCIQ9NVI1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
FANCIQ9NVI1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
FANCIQ9NVI1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
FANCIQ9NVI1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
FANCIQ9NVI1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
FANCIQ9NVI1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
FANCIQ9NVI1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
FANCIQ9NVI1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
FANCIQ9NVI1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
FANCIQ9NVI1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
FANCIQ9NVI1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
FANCIQ9NVI1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
FANCIQ9NVI1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FANCIQ9NVI1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FANCIQ9NVI1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FANCIQ9NVI1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FANCIQ9NVI1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FANCIQ9NVI1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FANCIQ9NVI1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FANCIQ9NVI1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FANCIQ9NVI1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FANCIQ9NVI1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FANCIQ9NVI1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FANCIQ9NVI1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FANCIQ9NVI1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FANCIQ9NVI1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FANCIQ9NVI1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FANCIQ9NVI1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FANCIQ9NVI1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
FANCIQ9NVI1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FANCIQ9NVI1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FANCIQ9NVI1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FANCIQ9NVI1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FANCIQ9NVI1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FANCIQ9NVI1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FANCIQ9NVI1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FANCIQ9NVI1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FANCIQ9NVI1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
FANCIQ9NVI1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FANCIQ9NVI1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FANCIQ9NVI1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FANCIQ9NVI1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FANCIQ9NVI1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FANCIQ9NVI1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FANCIQ9NVI1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FANCIQ9NVI1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FANCIQ9NVI1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FANCIQ9NVI1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FANCIQ9NVI1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FANCIQ9NVI1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FANCIQ9NVI1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms