Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG5

RPRD1B, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1BQ9NQG5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RPRD1BQ9NQG5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.4 ms