Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMIM3Q9BZL3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms