Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ19

ANKRD60, Ankyrin repeat domain-containing protein 60, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD60Q9BZ19 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD60Q9BZ19 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD60Q9BZ19 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD60Q9BZ19 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD60Q9BZ19 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD60Q9BZ19 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD60Q9BZ19 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD60Q9BZ19 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD60Q9BZ19 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD60Q9BZ19 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD60Q9BZ19 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD60Q9BZ19 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD60Q9BZ19 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD60Q9BZ19 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD60Q9BZ19 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD60Q9BZ19 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD60Q9BZ19 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD60Q9BZ19 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD60Q9BZ19 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD60Q9BZ19 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD60Q9BZ19 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD60Q9BZ19 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD60Q9BZ19 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD60Q9BZ19 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD60Q9BZ19 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD60Q9BZ19 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD60Q9BZ19 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD60Q9BZ19 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD60Q9BZ19 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD60Q9BZ19 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD60Q9BZ19 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD60Q9BZ19 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD60Q9BZ19 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD60Q9BZ19 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD60Q9BZ19 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD60Q9BZ19 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD60Q9BZ19 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD60Q9BZ19 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD60Q9BZ19 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD60Q9BZ19 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ANKRD60Q9BZ19 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ANKRD60Q9BZ19 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ANKRD60Q9BZ19 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ANKRD60Q9BZ19 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ANKRD60Q9BZ19 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ANKRD60Q9BZ19 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ANKRD60Q9BZ19 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ANKRD60Q9BZ19 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ANKRD60Q9BZ19 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ANKRD60Q9BZ19 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ANKRD60Q9BZ19 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ANKRD60Q9BZ19 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ANKRD60Q9BZ19 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ANKRD60Q9BZ19 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ANKRD60Q9BZ19 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
ANKRD60Q9BZ19 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ANKRD60Q9BZ19 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ANKRD60Q9BZ19 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ANKRD60Q9BZ19 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ANKRD60Q9BZ19 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ANKRD60Q9BZ19 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ANKRD60Q9BZ19 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ANKRD60Q9BZ19 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ANKRD60Q9BZ19 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ANKRD60Q9BZ19 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ANKRD60Q9BZ19 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ANKRD60Q9BZ19 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ANKRD60Q9BZ19 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ANKRD60Q9BZ19 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ANKRD60Q9BZ19 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ANKRD60Q9BZ19 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ANKRD60Q9BZ19 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ANKRD60Q9BZ19 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ANKRD60Q9BZ19 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ANKRD60Q9BZ19 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ANKRD60Q9BZ19 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ANKRD60Q9BZ19 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ANKRD60Q9BZ19 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ANKRD60Q9BZ19 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ANKRD60Q9BZ19 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ANKRD60Q9BZ19 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ANKRD60Q9BZ19 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ANKRD60Q9BZ19 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ANKRD60Q9BZ19 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ANKRD60Q9BZ19 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ANKRD60Q9BZ19 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ANKRD60Q9BZ19 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ANKRD60Q9BZ19 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ANKRD60Q9BZ19 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ANKRD60Q9BZ19 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ANKRD60Q9BZ19 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ANKRD60Q9BZ19 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ANKRD60Q9BZ19 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ANKRD60Q9BZ19 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ANKRD60Q9BZ19 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ANKRD60Q9BZ19 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ANKRD60Q9BZ19 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ANKRD60Q9BZ19 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ANKRD60Q9BZ19 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ANKRD60Q9BZ19 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms