Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PACSIN1Q9BY11 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PACSIN1Q9BY11 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PACSIN1Q9BY11 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PACSIN1Q9BY11 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PACSIN1Q9BY11 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PACSIN1Q9BY11 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PACSIN1Q9BY11 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PACSIN1Q9BY11 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PACSIN1Q9BY11 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PACSIN1Q9BY11 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PACSIN1Q9BY11 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PACSIN1Q9BY11 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PACSIN1Q9BY11 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PACSIN1Q9BY11 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PACSIN1Q9BY11 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PACSIN1Q9BY11 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PACSIN1Q9BY11 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PACSIN1Q9BY11 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PACSIN1Q9BY11 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PACSIN1Q9BY11 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PACSIN1Q9BY11 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PACSIN1Q9BY11 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PACSIN1Q9BY11 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PACSIN1Q9BY11 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PACSIN1Q9BY11 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PACSIN1Q9BY11 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PACSIN1Q9BY11 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PACSIN1Q9BY11 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PACSIN1Q9BY11 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PACSIN1Q9BY11 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PACSIN1Q9BY11 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PACSIN1Q9BY11 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PACSIN1Q9BY11 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PACSIN1Q9BY11 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PACSIN1Q9BY11 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PACSIN1Q9BY11 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PACSIN1Q9BY11 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PACSIN1Q9BY11 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PACSIN1Q9BY11 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PACSIN1Q9BY11 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PACSIN1Q9BY11 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PACSIN1Q9BY11 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PACSIN1Q9BY11 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PACSIN1Q9BY11 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PACSIN1Q9BY11 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PACSIN1Q9BY11 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PACSIN1Q9BY11 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PACSIN1Q9BY11 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PACSIN1Q9BY11 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PACSIN1Q9BY11 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PACSIN1Q9BY11 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PACSIN1Q9BY11 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PACSIN1Q9BY11 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PACSIN1Q9BY11 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PACSIN1Q9BY11 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PACSIN1Q9BY11 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PACSIN1Q9BY11 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PACSIN1Q9BY11 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PACSIN1Q9BY11 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PACSIN1Q9BY11 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PACSIN1Q9BY11 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PACSIN1Q9BY11 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PACSIN1Q9BY11 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PACSIN1Q9BY11 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PACSIN1Q9BY11 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PACSIN1Q9BY11 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PACSIN1Q9BY11 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PACSIN1Q9BY11 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PACSIN1Q9BY11 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PACSIN1Q9BY11 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PACSIN1Q9BY11 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PACSIN1Q9BY11 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms