Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC106Q9BWC9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC106Q9BWC9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC106Q9BWC9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC106Q9BWC9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC106Q9BWC9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC106Q9BWC9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC106Q9BWC9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC106Q9BWC9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC106Q9BWC9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC106Q9BWC9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC106Q9BWC9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC106Q9BWC9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC106Q9BWC9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC106Q9BWC9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC106Q9BWC9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC106Q9BWC9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC106Q9BWC9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC106Q9BWC9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC106Q9BWC9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC106Q9BWC9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC106Q9BWC9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC106Q9BWC9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC106Q9BWC9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC106Q9BWC9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC106Q9BWC9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC106Q9BWC9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC106Q9BWC9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC106Q9BWC9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC106Q9BWC9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC106Q9BWC9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC106Q9BWC9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC106Q9BWC9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC106Q9BWC9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC106Q9BWC9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC106Q9BWC9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms