Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms