Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CNBD2Q96M20 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CNBD2Q96M20 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CNBD2Q96M20 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CNBD2Q96M20 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CNBD2Q96M20 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CNBD2Q96M20 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CNBD2Q96M20 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CNBD2Q96M20 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CNBD2Q96M20 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CNBD2Q96M20 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CNBD2Q96M20 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNBD2Q96M20 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNBD2Q96M20 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNBD2Q96M20 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNBD2Q96M20 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNBD2Q96M20 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNBD2Q96M20 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNBD2Q96M20 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNBD2Q96M20 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNBD2Q96M20 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNBD2Q96M20 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNBD2Q96M20 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNBD2Q96M20 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNBD2Q96M20 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNBD2Q96M20 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNBD2Q96M20 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNBD2Q96M20 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNBD2Q96M20 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNBD2Q96M20 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNBD2Q96M20 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNBD2Q96M20 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNBD2Q96M20 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNBD2Q96M20 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNBD2Q96M20 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNBD2Q96M20 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNBD2Q96M20 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNBD2Q96M20 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNBD2Q96M20 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNBD2Q96M20 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNBD2Q96M20 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNBD2Q96M20 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CNBD2Q96M20 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNBD2Q96M20 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNBD2Q96M20 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNBD2Q96M20 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNBD2Q96M20 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNBD2Q96M20 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNBD2Q96M20 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNBD2Q96M20 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNBD2Q96M20 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNBD2Q96M20 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNBD2Q96M20 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CNBD2Q96M20 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CNBD2Q96M20 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CNBD2Q96M20 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CNBD2Q96M20 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CNBD2Q96M20 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CNBD2Q96M20 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CNBD2Q96M20 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.2 ms