Protein–RNA interactions for Protein: Q96D15

RCN3, Reticulocalbin-3, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN3Q96D15 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RCN3Q96D15 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RCN3Q96D15 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RCN3Q96D15 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RCN3Q96D15 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RCN3Q96D15 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RCN3Q96D15 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RCN3Q96D15 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RCN3Q96D15 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RCN3Q96D15 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RCN3Q96D15 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RCN3Q96D15 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RCN3Q96D15 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RCN3Q96D15 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RCN3Q96D15 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RCN3Q96D15 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RCN3Q96D15 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RCN3Q96D15 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RCN3Q96D15 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RCN3Q96D15 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RCN3Q96D15 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RCN3Q96D15 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RCN3Q96D15 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RCN3Q96D15 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RCN3Q96D15 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RCN3Q96D15 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms