Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CELF1Q92879 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CELF1Q92879 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CELF1Q92879 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CELF1Q92879 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CELF1Q92879 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CELF1Q92879 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CELF1Q92879 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CELF1Q92879 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CELF1Q92879 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CELF1Q92879 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CELF1Q92879 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CELF1Q92879 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CELF1Q92879 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CELF1Q92879 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CELF1Q92879 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CELF1Q92879 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CELF1Q92879 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CELF1Q92879 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CELF1Q92879 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CELF1Q92879 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CELF1Q92879 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CELF1Q92879 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CELF1Q92879 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CELF1Q92879 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CELF1Q92879 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CELF1Q92879 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CELF1Q92879 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CELF1Q92879 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CELF1Q92879 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CELF1Q92879 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CELF1Q92879 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CELF1Q92879 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CELF1Q92879 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CELF1Q92879 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CELF1Q92879 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CELF1Q92879 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CELF1Q92879 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CELF1Q92879 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CELF1Q92879 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CELF1Q92879 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CELF1Q92879 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CELF1Q92879 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CELF1Q92879 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms