Protein–RNA interactions for Protein: Q8N490

PNKD, Probable hydrolase PNKD, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKDQ8N490 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNKDQ8N490 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PNKDQ8N490 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNKDQ8N490 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNKDQ8N490 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNKDQ8N490 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNKDQ8N490 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNKDQ8N490 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNKDQ8N490 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNKDQ8N490 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PNKDQ8N490 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNKDQ8N490 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNKDQ8N490 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNKDQ8N490 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNKDQ8N490 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNKDQ8N490 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNKDQ8N490 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PNKDQ8N490 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PNKDQ8N490 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 209.2 ms