Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SKAP1Q86WV1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SKAP1Q86WV1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SKAP1Q86WV1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SKAP1Q86WV1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SKAP1Q86WV1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SKAP1Q86WV1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SKAP1Q86WV1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SKAP1Q86WV1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SKAP1Q86WV1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SKAP1Q86WV1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SKAP1Q86WV1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SKAP1Q86WV1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SKAP1Q86WV1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SKAP1Q86WV1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SKAP1Q86WV1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SKAP1Q86WV1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SKAP1Q86WV1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SKAP1Q86WV1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SKAP1Q86WV1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SKAP1Q86WV1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SKAP1Q86WV1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SKAP1Q86WV1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SKAP1Q86WV1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SKAP1Q86WV1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SKAP1Q86WV1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SKAP1Q86WV1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SKAP1Q86WV1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SKAP1Q86WV1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SKAP1Q86WV1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SKAP1Q86WV1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SKAP1Q86WV1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SKAP1Q86WV1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SKAP1Q86WV1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SKAP1Q86WV1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SKAP1Q86WV1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SKAP1Q86WV1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SKAP1Q86WV1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SKAP1Q86WV1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SKAP1Q86WV1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SKAP1Q86WV1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SKAP1Q86WV1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SKAP1Q86WV1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SKAP1Q86WV1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SKAP1Q86WV1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SKAP1Q86WV1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SKAP1Q86WV1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SKAP1Q86WV1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SKAP1Q86WV1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SKAP1Q86WV1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SKAP1Q86WV1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SKAP1Q86WV1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SKAP1Q86WV1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SKAP1Q86WV1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SKAP1Q86WV1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SKAP1Q86WV1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SKAP1Q86WV1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SKAP1Q86WV1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SKAP1Q86WV1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SKAP1Q86WV1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SKAP1Q86WV1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SKAP1Q86WV1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SKAP1Q86WV1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SKAP1Q86WV1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SKAP1Q86WV1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SKAP1Q86WV1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SKAP1Q86WV1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SKAP1Q86WV1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SKAP1Q86WV1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SKAP1Q86WV1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SKAP1Q86WV1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SKAP1Q86WV1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SKAP1Q86WV1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SKAP1Q86WV1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SKAP1Q86WV1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SKAP1Q86WV1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SKAP1Q86WV1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SKAP1Q86WV1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SKAP1Q86WV1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SKAP1Q86WV1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SKAP1Q86WV1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SKAP1Q86WV1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SKAP1Q86WV1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SKAP1Q86WV1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SKAP1Q86WV1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
SKAP1Q86WV1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SKAP1Q86WV1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SKAP1Q86WV1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SKAP1Q86WV1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SKAP1Q86WV1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SKAP1Q86WV1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SKAP1Q86WV1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SKAP1Q86WV1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SKAP1Q86WV1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SKAP1Q86WV1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SKAP1Q86WV1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SKAP1Q86WV1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SKAP1Q86WV1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SKAP1Q86WV1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SKAP1Q86WV1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.6 ms