Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ3

USP30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP30Q70CQ3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
USP30Q70CQ3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP30Q70CQ3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP30Q70CQ3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP30Q70CQ3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP30Q70CQ3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP30Q70CQ3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP30Q70CQ3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP30Q70CQ3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP30Q70CQ3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP30Q70CQ3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP30Q70CQ3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP30Q70CQ3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP30Q70CQ3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP30Q70CQ3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP30Q70CQ3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP30Q70CQ3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
USP30Q70CQ3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP30Q70CQ3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP30Q70CQ3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP30Q70CQ3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP30Q70CQ3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP30Q70CQ3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP30Q70CQ3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP30Q70CQ3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP30Q70CQ3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP30Q70CQ3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP30Q70CQ3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
USP30Q70CQ3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP30Q70CQ3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP30Q70CQ3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP30Q70CQ3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP30Q70CQ3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP30Q70CQ3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP30Q70CQ3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP30Q70CQ3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP30Q70CQ3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP30Q70CQ3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
USP30Q70CQ3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
USP30Q70CQ3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP30Q70CQ3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP30Q70CQ3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP30Q70CQ3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP30Q70CQ3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP30Q70CQ3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP30Q70CQ3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP30Q70CQ3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP30Q70CQ3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP30Q70CQ3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP30Q70CQ3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP30Q70CQ3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP30Q70CQ3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP30Q70CQ3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP30Q70CQ3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP30Q70CQ3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP30Q70CQ3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP30Q70CQ3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP30Q70CQ3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP30Q70CQ3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP30Q70CQ3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP30Q70CQ3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP30Q70CQ3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP30Q70CQ3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP30Q70CQ3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP30Q70CQ3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
USP30Q70CQ3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP30Q70CQ3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP30Q70CQ3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP30Q70CQ3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP30Q70CQ3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP30Q70CQ3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
USP30Q70CQ3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP30Q70CQ3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP30Q70CQ3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP30Q70CQ3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP30Q70CQ3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP30Q70CQ3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP30Q70CQ3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP30Q70CQ3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
USP30Q70CQ3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP30Q70CQ3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP30Q70CQ3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP30Q70CQ3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP30Q70CQ3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP30Q70CQ3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP30Q70CQ3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP30Q70CQ3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP30Q70CQ3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP30Q70CQ3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP30Q70CQ3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP30Q70CQ3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP30Q70CQ3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP30Q70CQ3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP30Q70CQ3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP30Q70CQ3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP30Q70CQ3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
USP30Q70CQ3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
USP30Q70CQ3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP30Q70CQ3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP30Q70CQ3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms