Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LETMD1Q6P1Q0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LETMD1Q6P1Q0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LETMD1Q6P1Q0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LETMD1Q6P1Q0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LETMD1Q6P1Q0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LETMD1Q6P1Q0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LETMD1Q6P1Q0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LETMD1Q6P1Q0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LETMD1Q6P1Q0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LETMD1Q6P1Q0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LETMD1Q6P1Q0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LETMD1Q6P1Q0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LETMD1Q6P1Q0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LETMD1Q6P1Q0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LETMD1Q6P1Q0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LETMD1Q6P1Q0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LETMD1Q6P1Q0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LETMD1Q6P1Q0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LETMD1Q6P1Q0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LETMD1Q6P1Q0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LETMD1Q6P1Q0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LETMD1Q6P1Q0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LETMD1Q6P1Q0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LETMD1Q6P1Q0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LETMD1Q6P1Q0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LETMD1Q6P1Q0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LETMD1Q6P1Q0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LETMD1Q6P1Q0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LETMD1Q6P1Q0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LETMD1Q6P1Q0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LETMD1Q6P1Q0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LETMD1Q6P1Q0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LETMD1Q6P1Q0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LETMD1Q6P1Q0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LETMD1Q6P1Q0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LETMD1Q6P1Q0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LETMD1Q6P1Q0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LETMD1Q6P1Q0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LETMD1Q6P1Q0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LETMD1Q6P1Q0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LETMD1Q6P1Q0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LETMD1Q6P1Q0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LETMD1Q6P1Q0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LETMD1Q6P1Q0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LETMD1Q6P1Q0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LETMD1Q6P1Q0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LETMD1Q6P1Q0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LETMD1Q6P1Q0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LETMD1Q6P1Q0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LETMD1Q6P1Q0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LETMD1Q6P1Q0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LETMD1Q6P1Q0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LETMD1Q6P1Q0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LETMD1Q6P1Q0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LETMD1Q6P1Q0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LETMD1Q6P1Q0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LETMD1Q6P1Q0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LETMD1Q6P1Q0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LETMD1Q6P1Q0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LETMD1Q6P1Q0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LETMD1Q6P1Q0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LETMD1Q6P1Q0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LETMD1Q6P1Q0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LETMD1Q6P1Q0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LETMD1Q6P1Q0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LETMD1Q6P1Q0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LETMD1Q6P1Q0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LETMD1Q6P1Q0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LETMD1Q6P1Q0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LETMD1Q6P1Q0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LETMD1Q6P1Q0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LETMD1Q6P1Q0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LETMD1Q6P1Q0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LETMD1Q6P1Q0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LETMD1Q6P1Q0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LETMD1Q6P1Q0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LETMD1Q6P1Q0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LETMD1Q6P1Q0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LETMD1Q6P1Q0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LETMD1Q6P1Q0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LETMD1Q6P1Q0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LETMD1Q6P1Q0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LETMD1Q6P1Q0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LETMD1Q6P1Q0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LETMD1Q6P1Q0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LETMD1Q6P1Q0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LETMD1Q6P1Q0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LETMD1Q6P1Q0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LETMD1Q6P1Q0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LETMD1Q6P1Q0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LETMD1Q6P1Q0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LETMD1Q6P1Q0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LETMD1Q6P1Q0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LETMD1Q6P1Q0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LETMD1Q6P1Q0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LETMD1Q6P1Q0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LETMD1Q6P1Q0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LETMD1Q6P1Q0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LETMD1Q6P1Q0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms