Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4D3

TMTC4, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMTC4Q5T4D3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMTC4Q5T4D3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMTC4Q5T4D3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMTC4Q5T4D3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMTC4Q5T4D3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMTC4Q5T4D3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMTC4Q5T4D3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMTC4Q5T4D3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMTC4Q5T4D3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMTC4Q5T4D3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMTC4Q5T4D3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMTC4Q5T4D3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMTC4Q5T4D3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMTC4Q5T4D3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMTC4Q5T4D3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMTC4Q5T4D3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMTC4Q5T4D3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMTC4Q5T4D3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMTC4Q5T4D3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMTC4Q5T4D3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMTC4Q5T4D3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMTC4Q5T4D3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMTC4Q5T4D3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMTC4Q5T4D3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMTC4Q5T4D3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMTC4Q5T4D3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMTC4Q5T4D3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMTC4Q5T4D3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMTC4Q5T4D3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMTC4Q5T4D3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMTC4Q5T4D3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMTC4Q5T4D3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMTC4Q5T4D3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMTC4Q5T4D3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMTC4Q5T4D3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMTC4Q5T4D3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMTC4Q5T4D3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMTC4Q5T4D3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMTC4Q5T4D3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMTC4Q5T4D3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMTC4Q5T4D3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMTC4Q5T4D3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMTC4Q5T4D3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMTC4Q5T4D3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMTC4Q5T4D3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMTC4Q5T4D3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMTC4Q5T4D3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMTC4Q5T4D3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMTC4Q5T4D3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMTC4Q5T4D3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMTC4Q5T4D3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMTC4Q5T4D3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMTC4Q5T4D3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMTC4Q5T4D3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMTC4Q5T4D3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMTC4Q5T4D3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMTC4Q5T4D3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMTC4Q5T4D3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMTC4Q5T4D3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMTC4Q5T4D3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMTC4Q5T4D3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMTC4Q5T4D3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMTC4Q5T4D3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMTC4Q5T4D3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMTC4Q5T4D3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMTC4Q5T4D3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMTC4Q5T4D3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMTC4Q5T4D3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMTC4Q5T4D3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMTC4Q5T4D3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMTC4Q5T4D3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMTC4Q5T4D3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMTC4Q5T4D3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMTC4Q5T4D3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMTC4Q5T4D3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMTC4Q5T4D3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMTC4Q5T4D3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMTC4Q5T4D3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMTC4Q5T4D3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMTC4Q5T4D3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMTC4Q5T4D3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMTC4Q5T4D3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMTC4Q5T4D3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMTC4Q5T4D3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMTC4Q5T4D3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMTC4Q5T4D3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMTC4Q5T4D3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMTC4Q5T4D3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMTC4Q5T4D3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMTC4Q5T4D3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMTC4Q5T4D3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMTC4Q5T4D3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMTC4Q5T4D3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMTC4Q5T4D3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMTC4Q5T4D3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMTC4Q5T4D3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMTC4Q5T4D3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMTC4Q5T4D3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMTC4Q5T4D3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMTC4Q5T4D3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms