Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC18A3Q16572 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC18A3Q16572 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC18A3Q16572 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC18A3Q16572 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC18A3Q16572 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC18A3Q16572 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC18A3Q16572 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC18A3Q16572 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC18A3Q16572 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC18A3Q16572 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC18A3Q16572 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC18A3Q16572 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC18A3Q16572 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC18A3Q16572 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC18A3Q16572 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC18A3Q16572 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC18A3Q16572 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC18A3Q16572 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC18A3Q16572 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC18A3Q16572 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC18A3Q16572 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC18A3Q16572 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC18A3Q16572 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC18A3Q16572 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC18A3Q16572 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC18A3Q16572 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC18A3Q16572 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC18A3Q16572 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC18A3Q16572 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC18A3Q16572 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC18A3Q16572 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC18A3Q16572 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC18A3Q16572 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC18A3Q16572 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC18A3Q16572 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC18A3Q16572 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC18A3Q16572 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC18A3Q16572 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC18A3Q16572 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC18A3Q16572 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC18A3Q16572 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC18A3Q16572 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC18A3Q16572 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC18A3Q16572 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC18A3Q16572 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC18A3Q16572 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC18A3Q16572 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC18A3Q16572 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC18A3Q16572 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC18A3Q16572 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC18A3Q16572 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC18A3Q16572 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC18A3Q16572 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC18A3Q16572 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC18A3Q16572 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC18A3Q16572 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC18A3Q16572 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC18A3Q16572 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC18A3Q16572 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC18A3Q16572 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC18A3Q16572 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC18A3Q16572 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC18A3Q16572 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC18A3Q16572 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC18A3Q16572 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC18A3Q16572 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC18A3Q16572 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC18A3Q16572 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC18A3Q16572 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC18A3Q16572 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC18A3Q16572 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC18A3Q16572 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC18A3Q16572 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC18A3Q16572 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC18A3Q16572 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC18A3Q16572 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC18A3Q16572 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC18A3Q16572 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
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