Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
COL19A1Q14993 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL19A1Q14993 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL19A1Q14993 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL19A1Q14993 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
COL19A1Q14993 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
COL19A1Q14993 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL19A1Q14993 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL19A1Q14993 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL19A1Q14993 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
COL19A1Q14993 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL19A1Q14993 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
COL19A1Q14993 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL19A1Q14993 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL19A1Q14993 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL19A1Q14993 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL19A1Q14993 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL19A1Q14993 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL19A1Q14993 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL19A1Q14993 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL19A1Q14993 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL19A1Q14993 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL19A1Q14993 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL19A1Q14993 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
COL19A1Q14993 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL19A1Q14993 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL19A1Q14993 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL19A1Q14993 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL19A1Q14993 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL19A1Q14993 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL19A1Q14993 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL19A1Q14993 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL19A1Q14993 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL19A1Q14993 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL19A1Q14993 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL19A1Q14993 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL19A1Q14993 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL19A1Q14993 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL19A1Q14993 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL19A1Q14993 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL19A1Q14993 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL19A1Q14993 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL19A1Q14993 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
COL19A1Q14993 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
COL19A1Q14993 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL19A1Q14993 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL19A1Q14993 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
COL19A1Q14993 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL19A1Q14993 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL19A1Q14993 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL19A1Q14993 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL19A1Q14993 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL19A1Q14993 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL19A1Q14993 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL19A1Q14993 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL19A1Q14993 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL19A1Q14993 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL19A1Q14993 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL19A1Q14993 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL19A1Q14993 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL19A1Q14993 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL19A1Q14993 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
COL19A1Q14993 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
COL19A1Q14993 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL19A1Q14993 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL19A1Q14993 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL19A1Q14993 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL19A1Q14993 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
COL19A1Q14993 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
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