Protein–RNA interactions for Protein: Q10587

TEF, Thyrotroph embryonic factor, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TEFQ10587 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TEFQ10587 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TEFQ10587 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TEFQ10587 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TEFQ10587 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TEFQ10587 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TEFQ10587 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TEFQ10587 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TEFQ10587 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TEFQ10587 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TEFQ10587 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TEFQ10587 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TEFQ10587 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TEFQ10587 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TEFQ10587 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TEFQ10587 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TEFQ10587 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TEFQ10587 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TEFQ10587 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TEFQ10587 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TEFQ10587 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TEFQ10587 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TEFQ10587 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TEFQ10587 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TEFQ10587 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TEFQ10587 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TEFQ10587 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TEFQ10587 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
TEFQ10587 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TEFQ10587 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TEFQ10587 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TEFQ10587 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TEFQ10587 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TEFQ10587 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TEFQ10587 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TEFQ10587 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TEFQ10587 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TEFQ10587 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TEFQ10587 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TEFQ10587 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TEFQ10587 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TEFQ10587 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TEFQ10587 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TEFQ10587 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TEFQ10587 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
TEFQ10587 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TEFQ10587 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TEFQ10587 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
TEFQ10587 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TEFQ10587 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TEFQ10587 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
TEFQ10587 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TEFQ10587 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TEFQ10587 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TEFQ10587 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TEFQ10587 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TEFQ10587 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TEFQ10587 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TEFQ10587 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TEFQ10587 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TEFQ10587 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TEFQ10587 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TEFQ10587 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TEFQ10587 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TEFQ10587 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TEFQ10587 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TEFQ10587 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
TEFQ10587 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TEFQ10587 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TEFQ10587 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TEFQ10587 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
TEFQ10587 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
TEFQ10587 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TEFQ10587 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TEFQ10587 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TEFQ10587 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TEFQ10587 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TEFQ10587 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TEFQ10587 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TEFQ10587 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TEFQ10587 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TEFQ10587 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TEFQ10587 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
TEFQ10587 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TEFQ10587 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TEFQ10587 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TEFQ10587 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
TEFQ10587 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TEFQ10587 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TEFQ10587 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
TEFQ10587 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TEFQ10587 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TEFQ10587 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TEFQ10587 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TEFQ10587 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TEFQ10587 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TEFQ10587 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
TEFQ10587 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TEFQ10587 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TEFQ10587 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms