Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APBA1Q02410 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APBA1Q02410 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APBA1Q02410 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APBA1Q02410 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APBA1Q02410 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APBA1Q02410 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APBA1Q02410 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APBA1Q02410 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APBA1Q02410 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APBA1Q02410 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APBA1Q02410 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APBA1Q02410 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APBA1Q02410 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APBA1Q02410 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APBA1Q02410 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APBA1Q02410 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APBA1Q02410 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APBA1Q02410 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APBA1Q02410 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APBA1Q02410 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APBA1Q02410 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APBA1Q02410 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APBA1Q02410 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APBA1Q02410 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APBA1Q02410 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APBA1Q02410 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APBA1Q02410 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APBA1Q02410 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APBA1Q02410 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APBA1Q02410 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APBA1Q02410 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APBA1Q02410 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APBA1Q02410 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APBA1Q02410 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APBA1Q02410 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
APBA1Q02410 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APBA1Q02410 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APBA1Q02410 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APBA1Q02410 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APBA1Q02410 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms