Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC1A2P43004 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC1A2P43004 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC1A2P43004 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC1A2P43004 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC1A2P43004 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC1A2P43004 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC1A2P43004 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC1A2P43004 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC1A2P43004 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC1A2P43004 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC1A2P43004 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC1A2P43004 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC1A2P43004 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC1A2P43004 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC1A2P43004 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC1A2P43004 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC1A2P43004 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC1A2P43004 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC1A2P43004 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC1A2P43004 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC1A2P43004 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC1A2P43004 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC1A2P43004 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A2P43004 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A2P43004 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A2P43004 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A2P43004 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A2P43004 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms