Protein–RNA interactions for Protein: P41250

GARS, Glycine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARSP41250 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GARSP41250 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GARSP41250 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GARSP41250 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GARSP41250 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GARSP41250 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GARSP41250 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GARSP41250 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GARSP41250 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GARSP41250 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GARSP41250 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GARSP41250 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GARSP41250 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GARSP41250 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GARSP41250 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GARSP41250 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GARSP41250 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GARSP41250 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GARSP41250 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GARSP41250 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GARSP41250 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GARSP41250 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GARSP41250 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GARSP41250 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GARSP41250 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GARSP41250 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GARSP41250 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GARSP41250 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GARSP41250 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GARSP41250 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GARSP41250 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GARSP41250 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GARSP41250 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GARSP41250 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GARSP41250 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GARSP41250 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GARSP41250 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GARSP41250 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GARSP41250 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GARSP41250 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GARSP41250 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GARSP41250 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GARSP41250 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GARSP41250 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GARSP41250 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GARSP41250 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GARSP41250 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GARSP41250 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GARSP41250 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GARSP41250 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GARSP41250 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GARSP41250 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GARSP41250 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GARSP41250 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GARSP41250 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GARSP41250 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GARSP41250 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GARSP41250 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GARSP41250 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GARSP41250 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GARSP41250 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GARSP41250 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GARSP41250 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GARSP41250 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GARSP41250 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GARSP41250 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GARSP41250 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GARSP41250 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GARSP41250 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GARSP41250 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GARSP41250 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GARSP41250 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GARSP41250 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GARSP41250 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GARSP41250 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GARSP41250 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GARSP41250 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GARSP41250 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GARSP41250 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GARSP41250 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GARSP41250 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GARSP41250 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GARSP41250 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GARSP41250 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GARSP41250 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GARSP41250 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GARSP41250 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GARSP41250 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GARSP41250 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GARSP41250 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GARSP41250 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GARSP41250 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GARSP41250 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GARSP41250 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GARSP41250 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GARSP41250 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GARSP41250 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GARSP41250 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GARSP41250 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GARSP41250 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms