Protein–RNA interactions for Protein: P35240

NF2, Merlin, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF2P35240 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NF2P35240 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NF2P35240 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NF2P35240 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NF2P35240 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NF2P35240 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NF2P35240 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NF2P35240 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NF2P35240 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NF2P35240 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NF2P35240 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NF2P35240 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NF2P35240 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NF2P35240 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NF2P35240 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NF2P35240 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NF2P35240 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NF2P35240 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NF2P35240 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NF2P35240 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NF2P35240 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NF2P35240 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NF2P35240 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NF2P35240 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NF2P35240 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NF2P35240 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NF2P35240 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NF2P35240 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NF2P35240 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NF2P35240 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NF2P35240 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NF2P35240 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NF2P35240 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NF2P35240 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NF2P35240 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NF2P35240 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NF2P35240 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NF2P35240 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NF2P35240 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NF2P35240 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NF2P35240 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NF2P35240 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NF2P35240 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NF2P35240 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NF2P35240 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NF2P35240 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NF2P35240 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NF2P35240 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NF2P35240 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NF2P35240 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NF2P35240 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NF2P35240 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NF2P35240 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NF2P35240 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NF2P35240 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NF2P35240 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NF2P35240 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NF2P35240 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NF2P35240 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NF2P35240 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NF2P35240 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NF2P35240 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NF2P35240 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NF2P35240 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NF2P35240 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NF2P35240 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NF2P35240 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NF2P35240 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NF2P35240 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NF2P35240 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NF2P35240 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NF2P35240 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NF2P35240 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NF2P35240 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NF2P35240 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NF2P35240 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NF2P35240 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NF2P35240 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NF2P35240 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NF2P35240 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NF2P35240 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NF2P35240 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NF2P35240 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NF2P35240 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NF2P35240 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NF2P35240 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NF2P35240 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NF2P35240 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NF2P35240 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NF2P35240 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NF2P35240 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NF2P35240 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NF2P35240 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NF2P35240 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NF2P35240 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NF2P35240 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NF2P35240 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NF2P35240 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NF2P35240 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NF2P35240 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 266 ms