Protein–RNA interactions for Protein: P32248

CCR7, C-C chemokine receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR7P32248 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCR7P32248 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCR7P32248 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR7P32248 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR7P32248 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR7P32248 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR7P32248 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR7P32248 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR7P32248 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR7P32248 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR7P32248 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR7P32248 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR7P32248 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR7P32248 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR7P32248 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR7P32248 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR7P32248 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR7P32248 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR7P32248 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR7P32248 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR7P32248 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR7P32248 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR7P32248 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR7P32248 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR7P32248 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR7P32248 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR7P32248 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR7P32248 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR7P32248 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR7P32248 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR7P32248 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR7P32248 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR7P32248 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR7P32248 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR7P32248 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR7P32248 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR7P32248 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR7P32248 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR7P32248 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR7P32248 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCR7P32248 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCR7P32248 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCR7P32248 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCR7P32248 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCR7P32248 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCR7P32248 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCR7P32248 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCR7P32248 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCR7P32248 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCR7P32248 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCR7P32248 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCR7P32248 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCR7P32248 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR7P32248 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR7P32248 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR7P32248 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR7P32248 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR7P32248 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR7P32248 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR7P32248 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR7P32248 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR7P32248 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR7P32248 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR7P32248 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR7P32248 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR7P32248 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR7P32248 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR7P32248 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR7P32248 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR7P32248 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR7P32248 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR7P32248 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR7P32248 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR7P32248 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR7P32248 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR7P32248 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCR7P32248 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCR7P32248 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCR7P32248 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCR7P32248 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCR7P32248 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCR7P32248 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCR7P32248 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCR7P32248 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCR7P32248 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCR7P32248 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCR7P32248 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCR7P32248 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCR7P32248 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCR7P32248 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR7P32248 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR7P32248 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR7P32248 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR7P32248 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR7P32248 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR7P32248 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR7P32248 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR7P32248 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR7P32248 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR7P32248 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms