Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERCC5P28715 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERCC5P28715 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERCC5P28715 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERCC5P28715 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERCC5P28715 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERCC5P28715 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERCC5P28715 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERCC5P28715 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERCC5P28715 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ERCC5P28715 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERCC5P28715 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERCC5P28715 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERCC5P28715 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERCC5P28715 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERCC5P28715 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERCC5P28715 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERCC5P28715 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC5P28715 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC5P28715 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC5P28715 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC5P28715 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC5P28715 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC5P28715 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC5P28715 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERCC5P28715 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERCC5P28715 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERCC5P28715 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERCC5P28715 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERCC5P28715 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERCC5P28715 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERCC5P28715 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ERCC5P28715 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ERCC5P28715 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ERCC5P28715 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ERCC5P28715 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC5P28715 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC5P28715 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC5P28715 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC5P28715 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC5P28715 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC5P28715 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC5P28715 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC5P28715 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC5P28715 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC5P28715 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC5P28715 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC5P28715 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC5P28715 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC5P28715 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC5P28715 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC5P28715 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC5P28715 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC5P28715 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC5P28715 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC5P28715 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC5P28715 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC5P28715 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERCC5P28715 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERCC5P28715 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERCC5P28715 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERCC5P28715 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERCC5P28715 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERCC5P28715 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC5P28715 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC5P28715 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC5P28715 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC5P28715 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC5P28715 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC5P28715 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC5P28715 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC5P28715 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC5P28715 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC5P28715 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC5P28715 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC5P28715 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC5P28715 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC5P28715 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC5P28715 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC5P28715 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC5P28715 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC5P28715 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC5P28715 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC5P28715 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC5P28715 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC5P28715 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC5P28715 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ERCC5P28715 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERCC5P28715 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERCC5P28715 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERCC5P28715 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERCC5P28715 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERCC5P28715 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERCC5P28715 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERCC5P28715 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERCC5P28715 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERCC5P28715 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERCC5P28715 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERCC5P28715 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERCC5P28715 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms