Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMB5P28074 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMB5P28074 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMB5P28074 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMB5P28074 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMB5P28074 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMB5P28074 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMB5P28074 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMB5P28074 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMB5P28074 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMB5P28074 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMB5P28074 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMB5P28074 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMB5P28074 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMB5P28074 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMB5P28074 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMB5P28074 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMB5P28074 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMB5P28074 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMB5P28074 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMB5P28074 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMB5P28074 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMB5P28074 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMB5P28074 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMB5P28074 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMB5P28074 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMB5P28074 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMB5P28074 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMB5P28074 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMB5P28074 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMB5P28074 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMB5P28074 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMB5P28074 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMB5P28074 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMB5P28074 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMB5P28074 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMB5P28074 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMB5P28074 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMB5P28074 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMB5P28074 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMB5P28074 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMB5P28074 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMB5P28074 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMB5P28074 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMB5P28074 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMB5P28074 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMB5P28074 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMB5P28074 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMB5P28074 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMB5P28074 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMB5P28074 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMB5P28074 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMB5P28074 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMB5P28074 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMB5P28074 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMB5P28074 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMB5P28074 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMB5P28074 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMB5P28074 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMB5P28074 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMB5P28074 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMB5P28074 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMB5P28074 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMB5P28074 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMB5P28074 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMB5P28074 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMB5P28074 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMB5P28074 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMB5P28074 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMB5P28074 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMB5P28074 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMB5P28074 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMB5P28074 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMB5P28074 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMB5P28074 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMB5P28074 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMB5P28074 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMB5P28074 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMB5P28074 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms