Protein–RNA interactions for Protein: P18669

PGAM1, Phosphoglycerate mutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM1P18669 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGAM1P18669 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGAM1P18669 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGAM1P18669 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGAM1P18669 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGAM1P18669 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGAM1P18669 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGAM1P18669 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PGAM1P18669 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGAM1P18669 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGAM1P18669 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGAM1P18669 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PGAM1P18669 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGAM1P18669 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGAM1P18669 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGAM1P18669 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGAM1P18669 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGAM1P18669 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGAM1P18669 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PGAM1P18669 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGAM1P18669 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGAM1P18669 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGAM1P18669 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGAM1P18669 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGAM1P18669 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGAM1P18669 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGAM1P18669 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGAM1P18669 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGAM1P18669 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGAM1P18669 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGAM1P18669 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGAM1P18669 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGAM1P18669 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGAM1P18669 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGAM1P18669 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGAM1P18669 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGAM1P18669 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGAM1P18669 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGAM1P18669 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGAM1P18669 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGAM1P18669 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGAM1P18669 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGAM1P18669 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PGAM1P18669 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGAM1P18669 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGAM1P18669 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGAM1P18669 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGAM1P18669 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGAM1P18669 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGAM1P18669 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGAM1P18669 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGAM1P18669 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGAM1P18669 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGAM1P18669 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PGAM1P18669 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGAM1P18669 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGAM1P18669 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGAM1P18669 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGAM1P18669 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGAM1P18669 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGAM1P18669 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGAM1P18669 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGAM1P18669 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGAM1P18669 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGAM1P18669 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGAM1P18669 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGAM1P18669 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGAM1P18669 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGAM1P18669 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGAM1P18669 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGAM1P18669 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGAM1P18669 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGAM1P18669 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGAM1P18669 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGAM1P18669 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGAM1P18669 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGAM1P18669 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGAM1P18669 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGAM1P18669 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGAM1P18669 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PGAM1P18669 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGAM1P18669 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PGAM1P18669 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGAM1P18669 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGAM1P18669 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGAM1P18669 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGAM1P18669 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGAM1P18669 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGAM1P18669 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGAM1P18669 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGAM1P18669 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGAM1P18669 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGAM1P18669 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGAM1P18669 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGAM1P18669 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGAM1P18669 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGAM1P18669 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGAM1P18669 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGAM1P18669 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGAM1P18669 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms