Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCG2P13521 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCG2P13521 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCG2P13521 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCG2P13521 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCG2P13521 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCG2P13521 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SCG2P13521 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SCG2P13521 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCG2P13521 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCG2P13521 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCG2P13521 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCG2P13521 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCG2P13521 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCG2P13521 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCG2P13521 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SCG2P13521 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCG2P13521 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SCG2P13521 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCG2P13521 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCG2P13521 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCG2P13521 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCG2P13521 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCG2P13521 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCG2P13521 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCG2P13521 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCG2P13521 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCG2P13521 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCG2P13521 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SCG2P13521 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCG2P13521 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCG2P13521 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCG2P13521 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCG2P13521 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCG2P13521 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCG2P13521 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCG2P13521 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCG2P13521 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCG2P13521 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCG2P13521 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCG2P13521 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCG2P13521 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCG2P13521 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCG2P13521 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCG2P13521 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCG2P13521 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCG2P13521 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCG2P13521 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SCG2P13521 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCG2P13521 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCG2P13521 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCG2P13521 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCG2P13521 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCG2P13521 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCG2P13521 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCG2P13521 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCG2P13521 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCG2P13521 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCG2P13521 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCG2P13521 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCG2P13521 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCG2P13521 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCG2P13521 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCG2P13521 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCG2P13521 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCG2P13521 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCG2P13521 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCG2P13521 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCG2P13521 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCG2P13521 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCG2P13521 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCG2P13521 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCG2P13521 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCG2P13521 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCG2P13521 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCG2P13521 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SCG2P13521 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SCG2P13521 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SCG2P13521 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCG2P13521 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCG2P13521 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCG2P13521 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCG2P13521 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCG2P13521 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCG2P13521 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCG2P13521 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCG2P13521 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCG2P13521 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCG2P13521 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCG2P13521 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SCG2P13521 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCG2P13521 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCG2P13521 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCG2P13521 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCG2P13521 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCG2P13521 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCG2P13521 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SCG2P13521 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCG2P13521 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCG2P13521 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms