Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGAMP11215 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGAMP11215 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGAMP11215 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGAMP11215 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGAMP11215 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGAMP11215 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGAMP11215 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGAMP11215 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGAMP11215 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGAMP11215 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGAMP11215 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGAMP11215 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGAMP11215 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGAMP11215 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGAMP11215 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGAMP11215 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGAMP11215 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGAMP11215 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGAMP11215 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGAMP11215 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGAMP11215 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGAMP11215 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGAMP11215 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGAMP11215 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGAMP11215 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGAMP11215 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGAMP11215 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGAMP11215 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGAMP11215 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGAMP11215 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGAMP11215 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGAMP11215 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGAMP11215 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGAMP11215 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGAMP11215 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGAMP11215 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGAMP11215 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGAMP11215 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGAMP11215 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGAMP11215 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms