Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC166P0CW27 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC166P0CW27 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC166P0CW27 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC166P0CW27 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC166P0CW27 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC166P0CW27 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC166P0CW27 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC166P0CW27 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC166P0CW27 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC166P0CW27 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC166P0CW27 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC166P0CW27 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC166P0CW27 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC166P0CW27 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC166P0CW27 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC166P0CW27 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC166P0CW27 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC166P0CW27 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC166P0CW27 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC166P0CW27 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC166P0CW27 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC166P0CW27 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC166P0CW27 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC166P0CW27 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC166P0CW27 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC166P0CW27 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC166P0CW27 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC166P0CW27 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC166P0CW27 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC166P0CW27 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC166P0CW27 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC166P0CW27 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC166P0CW27 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC166P0CW27 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC166P0CW27 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms