Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP3P08254 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP3P08254 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP3P08254 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP3P08254 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MMP3P08254 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MMP3P08254 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MMP3P08254 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MMP3P08254 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MMP3P08254 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MMP3P08254 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MMP3P08254 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMP3P08254 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMP3P08254 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MMP3P08254 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMP3P08254 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMP3P08254 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMP3P08254 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMP3P08254 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMP3P08254 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMP3P08254 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMP3P08254 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMP3P08254 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MMP3P08254 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MMP3P08254 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MMP3P08254 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MMP3P08254 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MMP3P08254 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MMP3P08254 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MMP3P08254 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MMP3P08254 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MMP3P08254 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MMP3P08254 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MMP3P08254 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MMP3P08254 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MMP3P08254 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MMP3P08254 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MMP3P08254 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MMP3P08254 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MMP3P08254 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MMP3P08254 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MMP3P08254 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MMP3P08254 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MMP3P08254 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MMP3P08254 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MMP3P08254 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MMP3P08254 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MMP3P08254 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MMP3P08254 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MMP3P08254 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MMP3P08254 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MMP3P08254 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MMP3P08254 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MMP3P08254 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MMP3P08254 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MMP3P08254 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MMP3P08254 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MMP3P08254 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MMP3P08254 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MMP3P08254 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MMP3P08254 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MMP3P08254 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MMP3P08254 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MMP3P08254 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MMP3P08254 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MMP3P08254 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MMP3P08254 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MMP3P08254 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MMP3P08254 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MMP3P08254 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MMP3P08254 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MMP3P08254 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MMP3P08254 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MMP3P08254 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MMP3P08254 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
MMP3P08254 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
MMP3P08254 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MMP3P08254 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MMP3P08254 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MMP3P08254 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
MMP3P08254 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MMP3P08254 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MMP3P08254 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MMP3P08254 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MMP3P08254 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MMP3P08254 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MMP3P08254 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MMP3P08254 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MMP3P08254 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MMP3P08254 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MMP3P08254 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MMP3P08254 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MMP3P08254 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MMP3P08254 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MMP3P08254 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MMP3P08254 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MMP3P08254 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MMP3P08254 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MMP3P08254 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MMP3P08254 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms