Protein–RNA interactions for Protein: P06340

HLA-DOA, HLA class II histocompatibility antigen, DO alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOAP06340 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HLA-DOAP06340 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HLA-DOAP06340 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HLA-DOAP06340 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HLA-DOAP06340 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HLA-DOAP06340 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HLA-DOAP06340 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HLA-DOAP06340 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HLA-DOAP06340 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HLA-DOAP06340 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HLA-DOAP06340 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HLA-DOAP06340 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HLA-DOAP06340 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HLA-DOAP06340 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HLA-DOAP06340 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HLA-DOAP06340 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HLA-DOAP06340 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HLA-DOAP06340 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HLA-DOAP06340 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HLA-DOAP06340 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HLA-DOAP06340 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HLA-DOAP06340 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HLA-DOAP06340 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HLA-DOAP06340 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HLA-DOAP06340 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HLA-DOAP06340 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HLA-DOAP06340 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HLA-DOAP06340 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HLA-DOAP06340 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
HLA-DOAP06340 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HLA-DOAP06340 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HLA-DOAP06340 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HLA-DOAP06340 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HLA-DOAP06340 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HLA-DOAP06340 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HLA-DOAP06340 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HLA-DOAP06340 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HLA-DOAP06340 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HLA-DOAP06340 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HLA-DOAP06340 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HLA-DOAP06340 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
HLA-DOAP06340 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HLA-DOAP06340 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
HLA-DOAP06340 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HLA-DOAP06340 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HLA-DOAP06340 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HLA-DOAP06340 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HLA-DOAP06340 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HLA-DOAP06340 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HLA-DOAP06340 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HLA-DOAP06340 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HLA-DOAP06340 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
HLA-DOAP06340 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HLA-DOAP06340 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HLA-DOAP06340 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
HLA-DOAP06340 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HLA-DOAP06340 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HLA-DOAP06340 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HLA-DOAP06340 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HLA-DOAP06340 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HLA-DOAP06340 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HLA-DOAP06340 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HLA-DOAP06340 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HLA-DOAP06340 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HLA-DOAP06340 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HLA-DOAP06340 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HLA-DOAP06340 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HLA-DOAP06340 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HLA-DOAP06340 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HLA-DOAP06340 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HLA-DOAP06340 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HLA-DOAP06340 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
HLA-DOAP06340 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HLA-DOAP06340 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HLA-DOAP06340 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HLA-DOAP06340 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HLA-DOAP06340 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HLA-DOAP06340 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HLA-DOAP06340 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HLA-DOAP06340 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HLA-DOAP06340 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HLA-DOAP06340 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HLA-DOAP06340 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HLA-DOAP06340 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
HLA-DOAP06340 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
HLA-DOAP06340 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HLA-DOAP06340 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HLA-DOAP06340 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HLA-DOAP06340 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HLA-DOAP06340 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HLA-DOAP06340 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HLA-DOAP06340 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HLA-DOAP06340 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HLA-DOAP06340 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HLA-DOAP06340 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
HLA-DOAP06340 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
HLA-DOAP06340 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
HLA-DOAP06340 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HLA-DOAP06340 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HLA-DOAP06340 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms