Protein–RNA interactions for Protein: O43736

ITM2A, Integral membrane protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2AO43736 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITM2AO43736 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITM2AO43736 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITM2AO43736 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITM2AO43736 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITM2AO43736 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITM2AO43736 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITM2AO43736 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITM2AO43736 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITM2AO43736 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITM2AO43736 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITM2AO43736 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITM2AO43736 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITM2AO43736 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITM2AO43736 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITM2AO43736 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITM2AO43736 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITM2AO43736 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITM2AO43736 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITM2AO43736 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITM2AO43736 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITM2AO43736 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITM2AO43736 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITM2AO43736 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITM2AO43736 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITM2AO43736 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITM2AO43736 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITM2AO43736 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITM2AO43736 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ITM2AO43736 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITM2AO43736 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ITM2AO43736 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITM2AO43736 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITM2AO43736 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITM2AO43736 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITM2AO43736 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITM2AO43736 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITM2AO43736 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITM2AO43736 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITM2AO43736 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITM2AO43736 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITM2AO43736 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITM2AO43736 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITM2AO43736 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITM2AO43736 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITM2AO43736 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITM2AO43736 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITM2AO43736 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITM2AO43736 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITM2AO43736 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITM2AO43736 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITM2AO43736 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ITM2AO43736 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITM2AO43736 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITM2AO43736 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITM2AO43736 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITM2AO43736 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITM2AO43736 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms