Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ODF3BA8MYP8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODF3BA8MYP8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODF3BA8MYP8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ODF3BA8MYP8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms