Protein–RNA interactions for Protein: A2RU48

SMCO3, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO3A2RU48 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms