Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ARFGEF2Q9Y6D5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ARFGEF2Q9Y6D5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ARFGEF2Q9Y6D5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ARFGEF2Q9Y6D5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ARFGEF2Q9Y6D5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARFGEF2Q9Y6D5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
ARFGEF2Q9Y6D5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARFGEF2Q9Y6D5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARFGEF2Q9Y6D5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARFGEF2Q9Y6D5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARFGEF2Q9Y6D5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARFGEF2Q9Y6D5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARFGEF2Q9Y6D5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARFGEF2Q9Y6D5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARFGEF2Q9Y6D5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARFGEF2Q9Y6D5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARFGEF2Q9Y6D5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARFGEF2Q9Y6D5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARFGEF2Q9Y6D5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARFGEF2Q9Y6D5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARFGEF2Q9Y6D5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARFGEF2Q9Y6D5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARFGEF2Q9Y6D5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARFGEF2Q9Y6D5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARFGEF2Q9Y6D5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARFGEF2Q9Y6D5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARFGEF2Q9Y6D5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARFGEF2Q9Y6D5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARFGEF2Q9Y6D5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARFGEF2Q9Y6D5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
ARFGEF2Q9Y6D5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARFGEF2Q9Y6D5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARFGEF2Q9Y6D5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARFGEF2Q9Y6D5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARFGEF2Q9Y6D5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
ARFGEF2Q9Y6D5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
ARFGEF2Q9Y6D5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
ARFGEF2Q9Y6D5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARFGEF2Q9Y6D5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARFGEF2Q9Y6D5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARFGEF2Q9Y6D5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARFGEF2Q9Y6D5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARFGEF2Q9Y6D5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARFGEF2Q9Y6D5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARFGEF2Q9Y6D5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARFGEF2Q9Y6D5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARFGEF2Q9Y6D5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARFGEF2Q9Y6D5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARFGEF2Q9Y6D5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
ARFGEF2Q9Y6D5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARFGEF2Q9Y6D5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARFGEF2Q9Y6D5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ARFGEF2Q9Y6D5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARFGEF2Q9Y6D5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARFGEF2Q9Y6D5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARFGEF2Q9Y6D5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARFGEF2Q9Y6D5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARFGEF2Q9Y6D5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARFGEF2Q9Y6D5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARFGEF2Q9Y6D5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
ARFGEF2Q9Y6D5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARFGEF2Q9Y6D5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARFGEF2Q9Y6D5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARFGEF2Q9Y6D5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARFGEF2Q9Y6D5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARFGEF2Q9Y6D5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARFGEF2Q9Y6D5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARFGEF2Q9Y6D5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARFGEF2Q9Y6D5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARFGEF2Q9Y6D5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARFGEF2Q9Y6D5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARFGEF2Q9Y6D5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARFGEF2Q9Y6D5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARFGEF2Q9Y6D5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ARFGEF2Q9Y6D5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARFGEF2Q9Y6D5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARFGEF2Q9Y6D5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ARFGEF2Q9Y6D5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ARFGEF2Q9Y6D5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARFGEF2Q9Y6D5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARFGEF2Q9Y6D5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARFGEF2Q9Y6D5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARFGEF2Q9Y6D5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARFGEF2Q9Y6D5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARFGEF2Q9Y6D5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARFGEF2Q9Y6D5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARFGEF2Q9Y6D5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARFGEF2Q9Y6D5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARFGEF2Q9Y6D5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARFGEF2Q9Y6D5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARFGEF2Q9Y6D5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARFGEF2Q9Y6D5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARFGEF2Q9Y6D5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARFGEF2Q9Y6D5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARFGEF2Q9Y6D5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARFGEF2Q9Y6D5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms