Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PAXBP1Q9Y5B6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PAXBP1Q9Y5B6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PAXBP1Q9Y5B6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PAXBP1Q9Y5B6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PAXBP1Q9Y5B6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PAXBP1Q9Y5B6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PAXBP1Q9Y5B6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PAXBP1Q9Y5B6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PAXBP1Q9Y5B6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PAXBP1Q9Y5B6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PAXBP1Q9Y5B6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PAXBP1Q9Y5B6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PAXBP1Q9Y5B6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PAXBP1Q9Y5B6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PAXBP1Q9Y5B6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PAXBP1Q9Y5B6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PAXBP1Q9Y5B6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PAXBP1Q9Y5B6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PAXBP1Q9Y5B6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PAXBP1Q9Y5B6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PAXBP1Q9Y5B6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PAXBP1Q9Y5B6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PAXBP1Q9Y5B6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PAXBP1Q9Y5B6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PAXBP1Q9Y5B6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PAXBP1Q9Y5B6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PAXBP1Q9Y5B6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PAXBP1Q9Y5B6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PAXBP1Q9Y5B6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PAXBP1Q9Y5B6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PAXBP1Q9Y5B6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PAXBP1Q9Y5B6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PAXBP1Q9Y5B6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PAXBP1Q9Y5B6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PAXBP1Q9Y5B6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PAXBP1Q9Y5B6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PAXBP1Q9Y5B6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PAXBP1Q9Y5B6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PAXBP1Q9Y5B6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PAXBP1Q9Y5B6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PAXBP1Q9Y5B6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PAXBP1Q9Y5B6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PAXBP1Q9Y5B6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PAXBP1Q9Y5B6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PAXBP1Q9Y5B6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PAXBP1Q9Y5B6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PAXBP1Q9Y5B6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms