Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FARSAQ9Y285 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FARSAQ9Y285 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FARSAQ9Y285 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FARSAQ9Y285 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FARSAQ9Y285 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FARSAQ9Y285 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FARSAQ9Y285 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FARSAQ9Y285 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FARSAQ9Y285 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FARSAQ9Y285 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FARSAQ9Y285 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FARSAQ9Y285 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FARSAQ9Y285 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARSAQ9Y285 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FARSAQ9Y285 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARSAQ9Y285 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARSAQ9Y285 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FARSAQ9Y285 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FARSAQ9Y285 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARSAQ9Y285 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARSAQ9Y285 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARSAQ9Y285 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARSAQ9Y285 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARSAQ9Y285 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FARSAQ9Y285 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FARSAQ9Y285 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FARSAQ9Y285 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FARSAQ9Y285 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FARSAQ9Y285 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FARSAQ9Y285 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FARSAQ9Y285 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FARSAQ9Y285 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FARSAQ9Y285 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FARSAQ9Y285 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FARSAQ9Y285 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FARSAQ9Y285 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FARSAQ9Y285 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FARSAQ9Y285 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FARSAQ9Y285 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FARSAQ9Y285 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FARSAQ9Y285 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FARSAQ9Y285 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FARSAQ9Y285 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FARSAQ9Y285 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FARSAQ9Y285 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FARSAQ9Y285 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FARSAQ9Y285 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FARSAQ9Y285 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FARSAQ9Y285 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FARSAQ9Y285 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FARSAQ9Y285 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FARSAQ9Y285 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FARSAQ9Y285 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FARSAQ9Y285 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FARSAQ9Y285 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FARSAQ9Y285 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FARSAQ9Y285 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FARSAQ9Y285 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FARSAQ9Y285 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FARSAQ9Y285 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FARSAQ9Y285 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FARSAQ9Y285 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FARSAQ9Y285 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms